Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM38O00635 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM38O00635 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms