Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3KRW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3KRW8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3KRW8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
J3KRW8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3KRW8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3KRW8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3KRW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3KRW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3KRW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3KRW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3KRW8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3KRW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3KRW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3KRW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3KRW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3KRW8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3KRW8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3KRW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3KRW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3KRW8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3KRW8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3KRW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3KRW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3KRW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3KRW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
J3KRW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3KRW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
J3KRW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3KRW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3KRW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3KRW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3KRW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3KRW8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3KRW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
J3KRW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3KRW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3KRW8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
J3KRW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3KRW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms