Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
ARID3CA6NKF2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ARID3CA6NKF2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARID3CA6NKF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARID3CA6NKF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms