Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC6Q9Y625 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC6Q9Y625 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC6Q9Y625 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms