Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB4Q9Y5E5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHB4Q9Y5E5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB4Q9Y5E5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms