Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FARP1Q9Y4F1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP1Q9Y4F1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms