Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HHLA3Q9XRX5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA3Q9XRX5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HHLA3Q9XRX5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms