Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX13Q9UN79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX13Q9UN79 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX13Q9UN79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX13Q9UN79 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms