Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC13A4Q9UKG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms