Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CYTH4Q9UIA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYTH4Q9UIA0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYTH4Q9UIA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH4Q9UIA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH4Q9UIA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH4Q9UIA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH4Q9UIA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms