Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTNNA3Q9UI47 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CTNNA3Q9UI47 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA3Q9UI47 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms