Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IRD1Q9UHL9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms