Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE7Q9UBL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE7Q9UBL6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms