Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN10Q9UBB4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms