Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMOD4Q9NZQ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD4Q9NZQ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD4Q9NZQ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms