Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms