Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM248Q9NWD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM248Q9NWD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM248Q9NWD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM248Q9NWD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM248Q9NWD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM248Q9NWD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM248Q9NWD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM248Q9NWD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM248Q9NWD8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms