Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIC8BQ9NVN3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIC8BQ9NVN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms