Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED17Q9NVC6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms