Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1Q9NPL8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1Q9NPL8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms