Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZCCHC17Q9NP64 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZCCHC17Q9NP64 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZCCHC17Q9NP64 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms