Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XAB2Q9HCS7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XAB2Q9HCS7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms