Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZC3H12CQ9C0D7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZC3H12CQ9C0D7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZC3H12CQ9C0D7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms