Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHCBP1LQ9BZQ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHCBP1LQ9BZQ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms