Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV8

CEP41, Centrosomal protein of 41 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP41Q9BYV8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP41Q9BYV8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP41Q9BYV8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP41Q9BYV8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP41Q9BYV8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP41Q9BYV8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP41Q9BYV8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP41Q9BYV8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP41Q9BYV8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP41Q9BYV8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP41Q9BYV8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP41Q9BYV8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms