Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC2Q9BYS8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC2Q9BYS8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC2Q9BYS8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC2Q9BYS8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms