Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDA1Q9BW61 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDA1Q9BW61 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms