Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MESP1Q9BRJ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MESP1Q9BRJ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms