Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RUFY1Q96T51 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY1Q96T51 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms