Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FAM71F1Q96KD3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms