Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NEURL4Q96JN8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NEURL4Q96JN8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NEURL4Q96JN8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NEURL4Q96JN8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NEURL4Q96JN8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms