Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC120Q96HB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC120Q96HB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC120Q96HB5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms