Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BCANQ96GW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BCANQ96GW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BCANQ96GW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
BCANQ96GW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms