Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARRDC3Q96B67 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARRDC3Q96B67 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARRDC3Q96B67 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms