Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCE1Q969G3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms