Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB13Q92826 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB13Q92826 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms