Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWG9

KCNE4, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 4, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE4Q8WWG9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE4Q8WWG9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE4Q8WWG9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNE4Q8WWG9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms