Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAJA4Q8WW22 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJA4Q8WW22 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJA4Q8WW22 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJA4Q8WW22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms