Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DTX3LQ8TDB6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DTX3LQ8TDB6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DTX3LQ8TDB6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms