Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTD1Q8N815 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTD1Q8N815 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTD1Q8N815 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms