Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CA13Q8N1Q1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA13Q8N1Q1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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