Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4X1Q8N118 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4X1Q8N118 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4X1Q8N118 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms