Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST9Q7L1S5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST9Q7L1S5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms