Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFVQ71UI9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFVQ71UI9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms