Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDF2Q6PJF5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms