Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIW4

FIGNL1, Fidgetin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIGNL1Q6PIW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIGNL1Q6PIW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FIGNL1Q6PIW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FIGNL1Q6PIW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FIGNL1Q6PIW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms