Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC39A4Q6P5W5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC39A4Q6P5W5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A4Q6P5W5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms