Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A1-AS1Q5TC04 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1-AS1Q5TC04 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms