Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1LQ5PSV4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRMS1LQ5PSV4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms