Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLEC12Q5KU26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms